Ich kenne keinen anderen Weg, als die Links jeweils anzupassen oder die betroffenen Lernmodule an einen kursübergreifenden Ort zu legen, auf den alle Beteiligten Zugriff haben.
Der Link weist ja auf ein bestimmtes Objekt. Selbst wenn sich im zweiten Kurs eine Verknüpfung des Lernmoduls befände, hat auch diese eine eigene Ref-ID und ist somit (linktechnisch!) unabhängig vom anderen Lernmodul.
Sollte jemand einen Weg kennen: Gerne her damit.