Ich hab den Fehler jetzt folgendermaßen behoben
1. Upgrade 5.3.3 -> 5.4.17
=> DBUpgrade machen
2. Upgrade 5.4.16 -> 6.3
=> Alle weiteren DBUpgrade durchführen
1. Upgrade 5.3.3 -> 5.4.17
=> DBUpgrade machen
2. Upgrade 5.4.16 -> 6.3
=> Alle weiteren DBUpgrade durchführen